Tras las duras críticas al recién presentado Metroid Prime: Federation Force en el Nintendo Digital Event, Kensuke Tanabe, el productor de la saga Metroid Prime, dijo en una entrevista realizada por IGN que le gustaría hacer un nuevo Prime. Estas fueron sus palabras:
Desde el principio dije que no estoy involucrado en ningún Metroid en 2D, eso es tarea del señor Sakamoto. Todavía creo que hay algo más de trabajo por hacer en mi caso con la serie ‘Metroid Prime’. No puedo decir cuándo, pero quiero hacer un nuevo Metroid.
Además añadió que le gustaría que tratara sobre la rivalidad entre Samus y Sylux. Por lo tanto deducimos que se trata de la secuela de Metroid Prime 3.